Научно-исследовательский институт биологии

Лаборатория "Проблемы адаптации биосистем"

 


 

The overarching theme of our research is a comparative study of physiological mechanisms of environmental adaptation and stress tolerance in highly specialized endemic species from Lake Baikal and common Palearctic species.

We use experimental and comparative approaches in order to understand how environmental stressors such as temperature, anoxia/hypoxia or toxicity pollution may limit survival and distribution of endemic amphipods in Lake Baikal.

This understanding is crucial for prognosis of the fate of endemic benthos populations, which comprise 1/3 of unique Lake Baikal biodiversity, in the face of the global environmental change or local anthropogenic hazards.

Our studies aimed to understand whether changed environment can reduce competitive abilities of the endemic Baikal species compared to their ubiquitous Palearctic counterparts.  Understanding the differences in tolerance and stress protection mechanisms between these species will provide important information for predicting the resilience of unique endemic Baikal fauna in the face of global climate change and may have important implications for future studies of the effects of global climate change on other ancient ecosystems worldwide.
 


Research in our lab is focused in the main areas:  

Freshwater and stress ecology
Environmental Physiology and Toxicology
Metabolic Physiology and Bioenergetics
 


Models:  We use several close-related endemic amphipods (Crustacea) and gastropods (Mollusca) as models for our research. Endemic species are comparied with different common distributed Palearctic gammaridae or lymnaeidae species. In Lake Baikal gastropods  and amphipods predominate, accounting for the greatest share of biodiversity and biomass. There are 148 species of gastropods (80% are Baikal endemics) and 272 species of amphipods (99% of them endemics) in the littoral zone of Baikal comprising 20% of the overall species diversity in the lake. Together, gastropods and amphipods constitute up to 98% of the total biomass of the macrobenthic organisms in Baikal and play a key role in the food chains and functioning of Baikal ecosystems


 

 
Лаборатория создана в апреле 2006 года.   
 
Основные цели и задачи Лаборатории 
Цель: 
Проведение фундаментальных научно-исследовательских, теоретических и прикладных работ в области экологии оз. Байкал и Байкальского региона. 
 
Задачи: 
1. Выполнение фундаментальных научно-исследовательских, теоретических и прикладных работ, связанных с изучением принципов и механизмов адаптации биологических систем к абиотическим и биотическим факторам окружающей среды на популяционном, этологическом, физиологическом, биохимическом и молекулярно-биологическом уровнях. 
2. Проведение практических занятий со студентами и аспирантам ИГУ, организация выполнения на базе Лаборатории курсовых, дипломных и диссертационных работ. 
3. Создание учебных пособий, публикация монографий и научных статей по результатам научно-исследовательских, теоретических и прикладных работ лаборатории. 
4. Повышение квалификации преподавателей ИГУ, качества подготовки аспирантов, специалистов путем их привлечения к научно-исследовательской работе 
 
 
Именные стипендии, номинации и поощрительные премии
За период существования Лаборатории студенты и аспиранты, выполняющие на ее базе дипломные и диссертационные работы были удостоены серией стипендий:
2-мя именными стипендиями Президента РФ для студентов (М. Протопопова 2007; Д. Аксенов-Грабанов, 2009).
3-мя именными стипендиями Правительства РФ для студентов (Д. Бедулина 2006; В. Павличенко, 2008; А.Гурков, 2011)
3-мя именными стипендиями для студентов Фонда им. Вернадского (М. Протопопова, 2007; В. Павличенко 2008; Д. Аксенов-Гибанов, 2010).
1-й   именной стипендией  Губернатора Иркутской области для студентов (Д. Аксенов-Грибанов, 2010).
2-мя именными стипендиями Губернатора Иркутской области для аспирантов (М. Протопопова, 2011; В. Павличенко, 2011).
2-мя именной стипендией для аспирантов Правительства РФ (М. Протопопова 2008; В. Павличенко, 2009).
2-мя именными стипендиями для аспирантов Президента РФ (Д. Бедулина 2008, В. Павличенко, 2010).
 
Сотрудникам Лаборатории М.А. Тимофееву, Ж.М. Шатилине, М.В. Протопоповой,  В.В. Павличенко, Д.Бедулиной и Е. Сапожниковой по результатам открытого конкурса НОЦ "Байкал" были присуждены  премии за публикации статей в ведущих рецензируемых журналах в 2008, 2009 и 2010 гг.
 
В марте 2013 года распоряжением Правительства Российской Федерации N 281-р  пятерым сотрудникам лаборатории присуждена премия Правительства Российской Федерации 2012 года в области науки и техники для молодых ученых и присвоено звание "Лауреат премии Правительства Российской Федерации в области науки и техники для молодых ученых".
 
Международное сотрудничество и коллаборации:
В настоящее время сотрудники лаборатории  выполняют совместные проекты с рядом отечественных и зарубежных исследовательских центров:  
            
      Центр экологических исследований им. Гельмгольца -UFZ (Лейпциг, Германия).
           Группа "Bioanalytical Ecotoxicology" Dr. Till Luckenbach
      Институт полярных и морских исследований им. Альфреда Вегенера -AWI (Бремерхафен, Германия).
           Группа "Integrative Ecophysiology" Prof. Dr. Hans-Otto Pörtner
      Крэнфилдский университет (Cranfield, UK) &  Университет Отаго (Dunedin, New Zealand)
           Группа "Bio-Photonics and Bio-Medical  Diagnostics" Dr. Igor Meglinski             
      Университет Северной Каролины (США).
           Группа "Physiological mechanisms of environmental adaptation and stress tolerance" Prof. Inna Sokolova
      Институт молекулярной биологии имени В. А. Энгельгардта РАН (г.Москва). 
           Лаборатория Молекулярных основ эволюции, д.б.н. Евгеньев Михаил Борисович 
      Институт биофизики СО РАН (г. Красноярск). 
           Лаборатория Биофизики экосистем,  к.б.н. Егор Сергеевич Задереев
      Лимнологический институт СО РАН (г.Иркутск). 
           Лаборатория биологии водных беспозвоночных, д.б.н. Ситникова Татьяна Яковлевна 
      Сибирский институт физиологии биохимии растений СО РАН (г. Иркутск).
           Лаборатория Физиологической генетики растений, д.б.н. Тамара Павловна Побежимова 
     
   
 Исследовательские центры, с которыми ранее проводились совместные научные проекты:
            
      Институт эволюции и биоразнообразия университета г. Мюнстер (Мюнстер, Германия).
           Группа "Research in Ecology and Biodiversity of Freshwater Systems" Prof. Dr. Elisabeth I. Meyer 
      Институт биологии Гумбольдского университета (г. Берлин, Германия). 
           Группа "Freshwater and Stress Ecology" Prof. Christian E.W. Steinberg 
       Институт экологии пресных вод и рыбоводства им Лейбница (г. Берлин, Германия).
           Группа "Biogeochemical Regulation"  Dr. Stephan Pflugmacher
      Зоологический институт Кристиан-Альбрехт Университета города Киль (г.Киль, Германия).
           Группа "Evolutionary ecophysiology" Dr. Martin Zimmer 
 
 

 

Основные публикации лаборатории "Проблемы адаптации биосистем"


2016  


 

Gurkov A.,  Shchapova E., Bedulina D., Baduev B., Borvinskaya E., Meglinski I., Timofeyev M. (2016) Remote in vivo stress assessment of aquatic animals with microencapsulated biomarkers for environmental monitoring. Scientific Reports,  6, 36427.

Timofeyev M.A., Silow E.A., Mackay A.W., Moore M.V., Likens G.E. (2016) Safeguarding the world’s largest lake. Nature. Vol.538, № 7623, pp. 41

Hampton S.E,…, Silow E.A.,…, Timofeyev M.A., et al. Ecology under lake ice. Ecology letters, 2016 (in press)

Vereshchagina K., Shatilina Z., Bedulina D., Gurkov A., Axenov-Gribanov D., Kondrateva E., Gubanov M., Zadereev E., Sokolova I.M. and Timofeyev M. Salinity modulates thermotolerance, energy metabolism and stress response in amphipods Gammarus lacustris. PeerJ. 2016 (in press)

Axenov-Gribanov D, Bedulina D, Shatilina Z, Jakob L, Vereshchagina K, Lubyaga Y, et al. (2016) Thermal Preference Ranges Correlate with Stable Signals of Universal Stress Markers in Lake Baikal Endemic and Holarctic Amphipods. PLoS ONE 11(10): e0164226. doi:10.1371/journal.pone.0164226

D.V. Axenov-Gribanov, I.V. Voytsekhovskaya, Y.V. Rebets, B.T. Tokovenko, T.A. Penzina, T.G. Gornostay, R.V. Adelshin, E.S. Protasov, A.N. Luzhetskyy, M.A. Timofeyev  "Actinobacteria possessing antimicrobial and antioxidant activities isolated from the pollen of scots pine (Pinus sylvestris) grown on the Baikal shore". Antonie van Leeuwenhoek Journal of Microbiology (2016) doi: 10.1007/s10482-016-0730-5.

Jakob L., D.V. Axenov-Gribanov, A. Gurkov, M. Ginzburg, D. Bedulina, M. Timofeyev, T. Luckenbach, M. Lucassen, F. Sartoris, Hans-O. Pörtner.  Lake Baikal  amphipods under climate change: Thermal constraints and ecological consequences. Ecosphere,  V.7, I.3, 2016.

Kobanova G.I., Takhteev V.V., Timofeyev M.A., Rusanovskaya O.O. (2016) Lake Baikal Ecosystem Faces the Threat of Eutrophication. International Journal of Ecology (in press). 

Karnaukhov D.Yu., Bedulina D.S., Kaus A., Prokosov S.O., Sartoris L., Timofeyev M.A., Takhteev V.V.    Behavior of Lake Baikal amphipods as a part of the night migratory complex in the Kluevka settlement region (South-Eastern Baikal). Crustaceana, 2016,  88(4): 419-430.

Axenov-Gribanov D.V., Voytsekhovskaya I.V., Tokovenko B.T., Protasov E.S., Gamaiunov S.V., Rebets Y.V., Luzhetskyy A.N.,  Timofeyev M.A. (2016) Actinobacteria isolated from an underground lake and moonmilk speleothem from the biggest conglomeratic rarstic cave in Siberia as sources of novel biologically active compounds. PLoS ONE 11(2): e0149216. doi:10.1371/journal.pone.0149216

Axenov-Gribanov D., Rebets Y., Tokovenko B., Voytsekhovskaya I., Timofeyev M., Luzhetskyy A. The isolation and characterization of actinobacteria from dominant benthic macroinvertebrates endemic to Lake Baikal. Folia Microbiologica,  Folia Microbiologica, March 2016, Volume 61, Issue 2, pp 159-168

 


2015  


 

Madyarova EV, Adelshin RV, Dimova MD, Axenov-Gribanov DV, Lubyaga YA, Timofeyev MA (2015) Microsporidian Parasites Found in the Hemolymph of Four Baikalian Endemic Amphipods. PLoS ONE 10(6): e0130311. doi:10.1371/journal.pone.0130311

 
Axenov-Gribanov D., Vereshchagina K., Lubyaga Y., Gurkov A., Bedulina D., Shatilina Zh., Homich A., Golubev A., Timofeyev M. Stress response at the cellular and biochemical levels indicates the limitation of the environmental temperature range for eastern Siberian populations of the common gastropod Lymnaea stagnalis. Malacologia, vol. 59(1), 33-44, 2015. 
 
 
V.V.Pavlichenko, M.V. Protopopova, M.Timofeyev, T. Luckenbach. Identification of a putatively multixenobiotic resistance related Abcb1 transporter in amphipod species endemic to the highly pristine Lake Baikal. Environmental Science and Pollution Research, April 2015, Volume 22, Issue 7, pp 5453-5468.
 
Luckenbach T., D. Bedulina, M. Timofeyev.  Is the Endemic Fauna of Lake Baikal Affected by Global Change? In Karthe, Daniel; Chalov, Sergey; Kasimov, Nikolay und Kappas, Martin (eds.) «Water and environment in the Selenga-Baikal basin:  International research cooperation for an ecoregion of global relevance» (Ibidem-Verlag, Stuttgart). 2015. P. 219-235. 
 

2014


D.S. Bedulina, V.V. Takhteev, S.G. Pogrebnyak, E.B. Govorukhina, E.V. Madjarova, Y.A. Lubyaga, K.P. Vereshchagina, M.A. Timofeyev, T. Luckenbach. On Eulimnogammarus messerschmidtii, sp. n. (Amphipoda: Gammaridea) from Lake Baikal, Siberia, with redescription of E. cyanoides (Sowinsky) and remarks on taxonomy of the genus Eulimnogammarus. Zootaxa 3838 (5): 518–544 (22 Jul. 2014)
 

L. Rivarola-Duarte, C. Otto, F. Juhling, S. Schreiber, D. Bedulina, L. Jakob, A. Gurkov, D. Axenov-Gribanov, A.H. Sahyoun, M. Lucassen, J. Hackermuller, S. Hoffmann, F. Sartoris, H.O. Portner, M. Timofeyev, T. Luckenbach, P.F. Stadler. A First Glimpse at the Genome of the Baikalian Amphipod Eulimnogammarus verrucosus. Journal of Experimental Zoology Part B: Molecular and Developmental Evolution, 2014 May;322(3):177-89.


D.V. Axenov-Gribanov, D.S. Bedulina, Z.M. Shatilina, Y.A. Lubyaga, K.P. Vereshchagina, M.A. Timofeyev. A cellular and metabolic assessment of the thermal stress responses in the endemic gastropod Benedictia limnaeoides ongurensis from Lake Baikal. Comparative Biochemistry and Physiology - Part B: Biochemistry & Molecular Biology,  Volume 167, January 2014, Pages 16–22

 


2013


 

     

    D.S. Bedulina, M.B. Evgen’ev, M.A. Timofeyev, M.V. Protopopova, D.G. Garbuz, V.V. Pavlichenko, T. Luckenbach, Z.M. Shatilina, D.V. Axenov-Gribanov, A.V. Gurkov, I.M. Sokolova, O.G. Zatsepina. Expression patterns and organization of the hsp70 genes correlate with thermotolerance in two congener endemic amphipod species (Eulimnogammarus cyaneus and E. verrucosus) from Lake Baikal. Molecular ecology, 2013, 22, 1416–1430.  

 


А.П. Голубев,  О.А. Бодиловская,  Л.Е.Слесарева,  Е.А.Самцова,   М.А.Тимофеев. Динамика численности  популяции  легочного моллюска Lymnaea stagnalis при  длительном размножении  посредством самооплодотворения.   Доклады академии наук. 2013 (принято в печать).

 


2012

 

   Тимофеев М.А. Байкаловедение: Глава 7.4. Разнообразие и эволюционные пути формирования стрессовой устойчивости эндемичных обитателей Байкала // В кн: Байкаловедение: учебник для студентов естественно-научных специальностей университетов: в 2 кн./отв. ред. О.Т. Русинек, В.В. Тахтеев и др. - Новосибирск: Наука, 2012.- Кн 2. С. 407-418


   Аксёнов-Грибанов Д. В., Лубяга Ю.А., Шахтанова Н.С., Гурков А.Н., Бедулина Д.С., Шатилина Ж.М., Кондратьева Е.М., Верещагина К.П., Тимофеев М.А.Определение температурного оптимума эндемичного байкальского вида амфипод Eulimnogammarus verrucosus (Gerstf., 1858) по изменениям показателей клеточного метаболизма  Журнал стресс-физиологии и биохимии, Vol. 8 No. 4 2012, pp. 289-301 

 

    Аксенов – Грибанов Д.В., Лубяга Ю.А. Влияние повышенной температуры окружающей среды на активность ферментов антиоксидантной системы и анаэробного гликолиза у эндемичных байкальских видов амфипод  Eulimnogammarus marituji, E. maackii иGmelinoides fasciatus. Журнал стресс-физиологии и биохимии, Vol. 8 No. 4 2012, pp. 322-329 

    
    Павличенко В.В. "Стресс-реакции пресноводных амфипод в условиях гипертермии и при интоксикации ксенобиотиками"Автореферат на соискание ученой степени кандидата биологических наук. – Иркутск, 2012. – 21 с.     
   
    A.N. Gurkov, D.V. Axenov-Gribanov, V.V. Pavlichenko, N.S. Shakhtanova, D.S. Bedulina, M.A. Timofeyev, V. Kalchenko, I. Meglinski, “Eco-Photonics: Application of optical diagnostic modalities for non-invasive monitoring and evaluation of stress conditions of aquatic organisms”, in: Saratov Fall Meeting 2011: Optical Technologies in Biophysics and Medicine XIII, Edited by V.V. Tuchin, E.A. Genina, I. Meglinski, Proc. SPIE, Vol.8337 (2012)

 

    Hofmann, S., Timofeyev, M.A., Putschew, A., Menzel, R., Steinberg, C.E.W. 2012. Leaf litter leachates have the potential to increase lifespan, body size, and offspring numbers in a clone of Moina macrocopa. Chemosphere, Volume 86, Issue 9, Pages 883-890.


 


2011

    

  
     Protopopova M.V., Takhteev V.V., Shatilina Zh.M., Pavlichenko V.V., Axenov-Gribanov D.V., Bedulina D.S., Timofeyev M.A.  Small HSPs molecular weights as new indication to the hypothesis of segregated status of thermophilic relict Gmelinoides fasciatus among Baikal and Palearctic amphipods. Journal of Stress Physiology & Biochemistry, Vol. 7, No. 2, 2011, pp. 175- 182.   

     Axenov-Gribanov, D. V., Gurkov, A. N., Shakhtanova, N. S., Bedulina, D. S., Timofeyev, M. A. and Meglinski, I. (2011), Optical diagnostic test of stress conditions of aquatic organisms. Journal of Biophotonics, 4: 4: 619–626. (по решению редакции журнала статья вынесена на титульный лист журнала - cover page).   

  
 

     Shatilina Z.M., H.W.Riss, M.V. Protopopova, M. Trippe, E.I. Meyer, V.V. Pavlichenko, D.S. Bedulina, D.V. Axenov-Gribanov, M.A. Timofeyev. The role of the heat shock proteins (HSP70 and sHSP) for the thermotolerance of freshwater amphipods from contrasting habitats. Journal of thermal biology, 2011, V. 36, I. 2, P. 142 – 149.   (статья победила в конкурсе CRDF Global (США) на лучшую научно-исследовательскую статью в биологии, опубликованную молодыми учёными в Научно-образовательных центрах - “2011 BRHE Young Scientists article competition”).

     Timofeyev M.A., Protopopova M.V. Stress resistance mechanisms in amphipods from Lake Baikal along a gradient of thermal change with emphasis on HSPs and antioxidant enzymes// in  Cipriano R.C., Bruckner A.W., Shchelkunov I.S., editors. 2011. – Bridging America and Russia with shared perspectives on aquatic animal health. Shepherdstown, West Virginia, USA, 2011 – P. 276 – 283.  
   
     Финников К.А., Корзун А.М., Колесниченко А.В. Моделирование теплопередачи в сообществе растений.  Журнал стресс-физиологии и биохимии, V7, №4 2011, С. 424-436 
 
    Колесниченко В.В., Колесниченко А.В. Изучение влияния высокой концентрации кадмия на функционирование антиоксидантных систем этиолированных проростков пшеницы разной длины.  Журнал стресс-физиологии и биохимии, V 7, № 3, 2011, С 212-221. 

    Ковчавцев А.П., Курышев Г.Л., Базовкин В.М., Половинкин В.Г., Настовьяк А.Е., Финников К.А., Корзун А.М., Колесниченко А.В., Войников В.К. Термографическая регистрация тепловых эффектов у растений при холодовом стрессе. Журнал стресс-физиологии и биохимии, V. 7, №4, 2011, С. 437-445. 

    Протопопова М.В. Механизмы неспецифической резистентности у байкальских и палеарктических амфипод в условиях интоксикации хлоридом кадмия. - Автореферат на соискание ученой степени кандидата биологических наук. – Красноярск, 2011. – 20 с.   
 

2010

 

     Bedulina D.S., Timofeyev M.A., Zimmer M., Zwirnmann E., Menzel R.,  Steinberg C.E.W. Different natural organic matter isolates cause similar stress response patterns in the freshwater amphipod, Gammarus pulex. Environmental Science and Pollution Research, 2010, 17, P. 261–269.      
 
   Bedulina D.S., Zimmer M., Timofeyev M.A. Sub-littoral and supra-littoral amphipods respond differently to acute thermal stress. Comparative biochemistry and physiology, Part B, 2010, 155, P. 413–418.  

   Steinberg C.E.W., Ouerghemmi N., Herrmann S., Bouchnak R., Timofeyev M.A., Menzel R. Stress by poor food quality and exposure to humic substances: Daphnia magna responds with oxidative stress, lifespan extension, but reduced offspring numbers. Hydrobiologia, 2010, 652, P. 223–236.      
    
    Steinberg C., Bedulina D.S., Pavlichenko V.V., Timofeyev M.A. Russischer Flohmarkt am Baikal. Aquaristik Fachmagazin, 2010, 216, P. 60-66.

    Тимофеев М.А., Кириченко К.А., Шатилина Ж.М., Рохин А.В., Побежимова Т.П. Отношение байкальских и палеарктических амфипод к кислороду как фактору среды и механизмы адаптации при снижении его уровня. Сибирский экологический журнал, 2010, 5, C. 717-724.  

     Шатилина Ж.М., Губанов М.В., Задереев Е.С.,  Павличенко В.В.,  Аксёнов-Грибанов Д.В.,   Сапожникова Е.А., Протопопова М.В., Бедулина Д.С., Тимофеев  М.А.  Сравнительное исследование клеточных механизмов термоустойчивости у представителей популяций Gammarus lacustris Sars, населяющих соленое оз. Шира (респ. Хакасия) и пресный водоем Прибайкалья. Доклады академии наук. 2010, Т. 434, №6, С. 846-849.

    Тимофеев М.А. «Экологические и физиологические аспекты адаптации к абиотическим факторам среды эндемичных байкальских и палеарктических амфипод». Автореферат диссертации на соискание степени доктора биологических наук, 2010, Томск, 44 c. 

    Шатилина Ж.М., Побежимова Т.П., Грабельных О.И., Бедулина Д.С., Протопопова М.В., Павличенко В.В., Тимофеев М.А. Белки теплового шока в механизмах стресс-адаптации у байкальских амфипод и палеарктического Gammarus lacustris Sars: I. Семейство БТШ70. Сибирский экологический журнал, 2010, № 1, C. 57–67. 

    Шатилина Ж.М., Бедулина Д.С., Протопопова М.В., Павличенко В.В., Побежимова Т.П., Грабельных О.И., Тимофеев М.А. Белки теплового шока в механизмах стресс-адаптации у байкальских амфипод и палеарктического Gammarus lacustris Sars: II. Семейство низкомолекулярные (малые) БТШ. Сибирский экологический журнал, 2010, № 4, C. 623-632. 

    Тимофеев М.А., Ж.М. Шатилина, В.В. Павличенко, Д.С. Бедулина, М.В. Протопопова, Д.В. Аксенов-Грибанов, Е.А. Сапожникова. Оценка активности механизма множественной резистентности пресноводных амфипод к ксенобиотикам по интенсивности выведения родамина C. Известия Иркутского государственного университета, Серия «Биология. Экология», 2010, Т. 3, № 2, С. 14–19.

  Тимофеев М.А., Ж.М. Шатилина. Определение рН-преферендума и чувствительности к уровню растворенного кислорода у байкальских эндемичных и палеарктических амфипод. Амурский зоологический журнал, 2010, II(1), С. 3-8.
  
   Финников К.А., А.В. Минаков, А.А. Дектерев, А.А. Гаврилов, А.М. Корзун, В.К. Войников, А.В. Колесниченко.  Математическое моделирование теплообмена между проростком растения и окружающей средой во время радиационного заморозка. Журнал стресс-физиологии и биохимии, V.6, №4, 2010, С. 108-125    
    

2009


    Steinberg C.E.W., Timofeyev M.A. and Menzel R. Dissolved Humic Substances: Interactions with Organisms. In: Gene E. Likens, (Editor) Encyclopedia of Inland Waters. V. 2, P. 747-753, 2009, Oxford: Elsevier.  
 
    Timofeyev М., Z.M. Shatilina, M.V. Protopopova, D.S. Bedulina, V.V. Pavlichenko, A.V. Kolesnichenko, C.E.W. Steinberg. Thermal stress defense in freshwater amphipods from contrasting habitats with emphasis on small heat shock proteins (sHSPs). Journal of Thermal Biology, 2009, 34, P. 281–285.  

    Бедулина Д.С. Влияние температурного фактора на клеточные и биохимические механизмы у байкальских и палеарктических амфипод. Автореферат диссертации на соискание степени кандидата биологических наук. Иркутск, 2009, 23 c. 

    Павличенко В.В., Шатилина Ж.М., Бедулина Д.С., Протопопова М.В., Сапожникова Е.А., Аксёнов-Грибанов Д.В., Бадуев Б.К., Тимофеев М.А. Накопление лактата и белков теплового шока (БТШ) при остром температурном стрессе у байкальских термочувствительных Eulimnogammarus vittatus и Eulimnogammarus marituji (Crustacea, Amphipoda). Амурский зоологический журнал, 2009,  I(3),  С. 190-196.

    Timofeyev M., Protopopova M., Pavlichenko V., Steinberg C. Can acclimation of amphipods change their antioxidative response? Aquatic Ecology, 2009, 43, P. 1041–1045.  

    Тимофеев М.А. Активация  антиоксидантной  системы  у байкальского литорального  вида  Eulimnogammarus  verrucosus// Известия Самарского Научного Центра РАН  2009. Т. 11. 1. 177-180.
 

2008


     Чепинога А.В., Чепинога А.А., Гнутиков А.А., Тимофеев М.А. Обзор кариологической изученности флоры байкальского региона. Известия Самарского Научного Центра РАН,  2008, Т. 10, 5/1,  С. 68-73.

     Тимофеев М.А.  Особенности механизмов активации АОС у пресноводных амфипод: II. Байкальский литоральный Eulimnogammarus cyaneus (Dyb.) (Amphipoda, Crustacea). Сибирский экологический журнал, 2008, № 5, С. 681-687. 
 
     Тимофеев М.А., Ж.М. Шатилина, Д.С. Бедулина, М.В. Протопопова, А.В. Колесниченко. Особенности применения белков теплового шока (БТШ) в качестве стресс-маркеров у байкальских эндемичных амфипод. Прикладная биохимия и микробиология, 2008, Т.3, С. 310-313.

     Колесниченко А.В., М.А.Тимофеев, М.В. Протопопова. Токсичность наноматериалов - 15 лет исследований. Российские нанотехнологии, 2008, Т. 3, № 3-4,  С. 54 - 61.   

     Steinberg C.E.W., Meinelt T., Timofeyev M.A., Bittner M., Menzel R. Humic Substances. Part 2: Interactions with Organisms. Environmental Science and Pollution Research,  2008, 15 (2), P. 128–135.     

     Тимофеев М.А., Шатилина Ж.М., Бедулина Д.С., Протопопова М.В., Павличенко В.В., Колесниченко А.В. Сравнительное исследование клеточных механизмов терморезистентности у байкальского и палеарктического видов эврибионтных амфипод. Сибирский экологический журнал, 2008, № 1, T. 15, C. 23–29.  

     Timofeyev M., Shatilina Z. M , Bedulina D.S., Protopopova M.V., Pavlichenko V., Grabelnich O.I., Kolesnichenko A.V. Evaluation of biochemical responses in Palearctic and Lake Baikal endemic amphipod species exposed to CdCl2. Ecotoxicol. Environm. Safety, 2008, V. 70, I. 1, P. 99-105.    
    
    Тимофеев М.А., Лозовой Д.В., Потапов Д.С., Шатилина Ж.М., Сапожникова Е.А., Аксенов-Грибанов Д.В., Павличенко В.В. Вестерн-иммуноблоттинг белков теплового шока у пресноводных гастропод и амфипод, экспонированных в растворах нефти. Известия ИГУ, Серия «Биология. Экология», 2008, T. 1, № 2, С. 20-23.
     
     Чепинога В.В., Гнутиков А.А., Енущенко И.В. Числа хромосом некоторых видов сосудистых растений флоры Байкальской Сибири. Бот. журн., 2008, Т. 93, № 8, C. 128-137.

     Чепинога В.В., Росбах С.А. Активность различных видов водной флоры Иркутско-Черемховской равнины. География и природные ресурсы, 2008, № 1, С. 97-104.

     Chepinoga V.V., Gnutikov A.A., Enushchenko I.V., Chepinoga A.V. IAPT/IOPB chromosome data 6. Taxon, 2008, 57 (4), P. 1-2.
 

2007

 


    Флора высших растений озера Байкал / М. Г. Азовский, В. В. Чепинога; [отв. ред. Л. В. Бардунов]. – Иркутск : Изд-во Иркут. гос. ун-та, 2007, 157 с. ISBN 978–5–9624–0211–6.  

    Материалы к флоре Байкальской Сибири: сб. науч. ст. / [отв. ред. В. В. Чепинога]. – Иркутск : Изд-во Иркут. ун-та, 2007, Вып. 1, 173 с.  

    Timofeyev M., Shatilina Z.  Different preference reactions of three Lake Baikal endemic amphipods to temperature and oxygen are correlated with symbiotic life. Crustaceana, 2007, 80(2), Р. 129-138.  

    Timofeyev M.,  Shatilina Z.M., Bedulina D.S., Menzel R., Steinberg C.E.W.  Natural organic matter (NOM) has the potential to modify the multixenobiotic resistance (MXR) activity in freshwater amphipods Eulimnogammarus cyaneus (Dyb) and Eulimnogammarus verrucosus(Gerst.). Comparative biochemistry and physiology, Part B, 2007, 146, Р. 496–503.    

   Кириченко К.А. «Отношение байкальских и палеарктических амфипод к кислороду как фактору среды и механизмы адаптации при снижении его уровня». Автореферат диссертации на соискание степени кандидата биологических наук, 2007, Иркутск, 20 с. 

    Тимофеев М.А.  Изучение  активности некоторых антиоксидантных ферментов у байкальских амфипод,  локализация и размерно-возрастная зависимость. Сибирский экологический журнал, 2007, №4, С. 521 – 526.  
 

   2006


     Timofeyev M.A., Steinberg C. Аntioxidant response to natural organic matter (NOM) exposure in three Baikalean amphipod species from contrasting habitats.  Comparative biochemistry and physiology, Part B, 2006, 145, Р. 197–203.    

     Timofeyev M., Shatilina Z., Kolesnichenko A., Kolesnichenko V., Bedulina D., Steinberg C.  Natural organic matter (NOM) induces oxidative stress in freshwater amphipods Gammarus lacustris Sars and G. tigrinus (Sexton). Science of The Total Environment, 2006, V.366 (2-3), P. 673-681.     

     Timofeyev M. Antioxidant enzyme activity in endemic Baikalean versus Palaearctic amphipods: Tagma- and size-related changes. Comparative biochemistry and physiology, Part B, 2006, V. 143/3, P. 302-308.  

     Timofeyev M., Z. Shatilina, A. Kolesnichenko, V. Kolesnichenko,  S. Pflugmacher, C. Steinberg. Specific antioxidants reaction to oxidative stress promoted by natural organic matter (NOM) in two endemic amphipod species from Lake Baikal. Environmental Toxicology, 2006, V. 21, I. 2,  P. 104-110.    

     Тимофеев М.А., Кириченко К.А., Бедулина Д.С. Сравнительная оценка особенностей анаэробного метаболизма у байкальских амфипод Eulimnogammarus verrucosus (Gerstf.), E. cyaneus (Dyb.) и палеарктического Gammarus lacustris Sars. Сибирский экологический журнал, 2006, T. 13, № 6, C. 733-739.  
     Тимофеев М.А., Шатилина Ж.М., Колесниченко А.В., Бедулина Д.С. Полиморфизм белковых спектров эндемичных амфипод озера Байкал  и  палеарктических видов, влияние температурного стресса. Сибирский экологический журнал, 2006, №5, C. 571-579. 

     Тимофеев М.А. Особенности механизмов активации АОС у пресноводных амфипод: I. Палеарктический  Gammarus lacustris Sars (Amphipoda, Crustacea). Сибирский экологический журнал, 2006, №5, C. 623-628. 
 
     Тимофеев М.А., Шатилина Ж.М., Бедулина Д.С., Протопопова М.В., Грабельных О.И., Побежимова Т.П., Колесниченко А.В. Стрессовые белки в механизмах стресс-адаптации байкальских амфипод, сопоставление с палеарктическими видами. Журнал стресс-физиологии и биохимии, 2006, Т. 2,  № 1,  С. 41-49. 

     Тимофеев М.А., Кириченко К.А., Рохин А.В., Бедулина Д.С., Чернышова К.П., Побежимова Т.П.  Индукция анаэробных процессов у байкальских эндемиков Eulimnogammarus vittatus (Dyb.) и E.verrucosus (Dyb.) (Amphipoda, Crustacea). Журнал стресс-физиологии и биохимии, 2006, Т. 2, № 1, С. 56-61.   
 
     Тимофеев М.А., Шатилина Ж.М., Колесниченко А.В. Токсичность солей кадмия для байкальских эндемичных амфипод, некоторые биохимические последствия. Сибирский экологический журнал, 2006, №2, C. 243-248. 

     Steinberg C., S. Kamara, V. Prokhotskaya, L. Manusadžianasp, T. Karasyova, M.  Timofeyev, Z. Jie, A. Paul, T. Meinel, V. Farjallap, A. Matsuo, K. Burnison, R. Menzel. Dissolved humic substances – ecological driving forces from the individual to the ecosystem level? (Review). Freshwater Biology, 2006, 51, P. 1189–1210.    

     Тимофеев М.А., Кириченко К.А., Бедулина Д.С., Рохин А.В., Чернышова К.П., Побежимова Т.П. Активация альтернативных путей энергопродукции у байкальского эндемичного вида E. vittatus (Amphipoda, Crustacea). Гидробиология водоемов юга Восточной Сибири (Биоразнообразие Байкальского региона: Труды Биолого-почвенного факультета ИГУ, Выпуск 6), Иркутск: Иркутск. Ун-т, 2006, C. 94-101. 

     Шатилина Ж.М., Бедулина Д.С., Тимофеев М.А.  Оценка антропогенного загрязнения по активности механизма множественной резистентности к ксенобиотикам на примере пресноводных амфипод. Гидробиология водоемов юга Восточной Сибири (Биоразнообразие Байкальского региона: Труды Биолого-почвенного факультета ИГУ, Выпуск 6), Иркутск: Иркутск. Ун-т, 2006., C. 101-111.

      Тимофеев М.А., Шатилина Ж.М., Кириченко К.А., Бедулина Д.С., Протопопова М.В. О возможности использования показателя общей пероксидазной активности в качестве стресс-маркеров у байкальских организмов. Вестник Бурятского Университета, Улан-Удэ, Изд. Бурятского госуниверситета, 2006, С. 223.  
2005.
 

2005-2004


          Тимофеев М.А., К.А. Кириченко. Экспериментальная оценка роли абиотических факторов в ограничении распространения эндемиков за пределы оз. Байкал, на примере амфипод. Сибирский экологический журнал, 2004, №1, C. 41–50.

     Шатилина Ж.М., Бедулина Д.С., Тимофеев М.А. Изучение биохимических механизмов стрессовой адаптации пресноводных амфипод, активирующихся в ответ на влияние биотических факторов. Вестник Томского государственного университета. Серия «Естественные науки», 2004, №11, C. 143.

     Шатилина Ж.М., Бедулина Д.С., Тимофеев М.А. Особенности активации механизмов антиоксидантной защиты у эндемичных байкальских амфипод. Вестник Томского государственного университета, Серия «Естественные науки», 2004, №11,  C. 144.

     Кириченко К.А., Бедулина Д.С., Тимофеев М.А. Оценка влияния пониженного содержания растворенного кислорода на резистентные способности байкальских амфипод. Вестник Томского государственного университета, Серия «Естественные науки», 2004, №11, C. 115-116.

     Кириченко К.А., Бедулина Д.С., Тимофеев М.А. Индукция анаэробных процессов у байкальских эндемичных амфипод в условиях гипоксии. Вестник Томского государственного университета, Серия «Естественные науки», 2004, №11, C. 116.

     Тимофеев М.А. Оценка активности антиоксидантных ферментов пероксидазы и каталазы у байкальских амфипод, локализация и размерно-возрастная зависимость. Вестник Томского государственного университета, Серия «Естественные науки», 2004, №11,  C. 139.

      Таганов И.Н., Н.Л. Денисов, М.А. Тимофеев, А.О. Бринкен. Микроэлементы и тяжелые металлы в доминирующих гидробионтах оз. Байкал. Сообщение II. Изв. РГО, 2005, Т.137, Вып. 2, C. 76 - 82.

     Wiegand C., Meems N., Timofeyev M.A., Steinberg C., Pflugmacher S.  More evidence for humic substances acting as biogeochemicals on organisms. In: Humic Substances: Nature's  Most Versatile Materials. Eds. E. A. Ghabbour and G. Davies, Francis & Taylor New York. 2004, P. 340-372. 

      Timofeyev M., C. Wiegand, B.K. Burnison, Z.M. Shatilina, S. Pflugmacher, C.E.W. Steinberg. Impact of natural organic matter (NOM) on freshwater amphipods. The Science of the Total Environment, 2004, V. 319, I. 1-3, P. 115-121.  

Тимофеев М.А.

Шатилина Ж.М.

Бедулина Д.С.

Аксенов-Грибанов Д.В.

Лозовой Д.В.

Мадьярова Е.В.

Верещагина К.П.

Лубяга Ю.А.

Протасов Е.А.

Кондратьева Е.С.

Войцеховская И.В.

Димова М.Д.